大豆を納豆菌で発酵させた食品である。たんぱく質はもちろんのことミネラルやビタミンが豊富に含まれ、なかでも骨を作るのに不可欠なビタミンＫやナットウキナーゼ１）を含むことで注目されている。食物繊維は100グラム中に4.9～7.6グラムと豊富に含まれる。食物繊維はオリゴ糖などと共にプレバイオティクスと呼ばれ、腸内環境に有用な成分である。納豆菌はプロバイオティクスと呼ばれ、これも腸内環境に有用と考えられている。
納豆に含まれるレシチンは記憶力や学習能力を高め、血中コレステロールの低下による脂質異常症の予防、血圧低下作用による高血圧予防。たんぱく質は脳内の神経化学伝達物質の合成を活発化する。コリンは脳の神経化学伝達物質の材料となる。ビタミンＢ１は中枢神経と末梢神経の機能を保つ。カルシウムは不足すると集中力が低下する。ビタミンＫは脳の神経伝達を活性化する。カリウムは無気力を防ぐ。マグネシウムは高ぶった神経を鎮静化する。ジピコリン酸、リゾチームはO157病原性大腸菌、サルモネラ菌などの抗菌効果。イソフラボン、SODの抗酸化作用による生活習慣病予防のほか、健脳効果（神経伝達物質の活性化、血液循環の改善）、血栓溶解作用、骨形成促進作用、カルシウム吸収促進作用など多様な効果が知られている。
ビタミンK2は抗凝血薬（ワルファリン）の作用を弱めることから、ワルファリンの服用中は、納豆は避けるべきである。
